上海香料研究所前身是由原食品工业部上海食品油脂工业公司于1956年7月筹建的香料工业研究室，开始在复兴中路470号，同年10月迁至虹桥路850号开展科研工作。

    1956年12月香料研究室划归原食品工业部上海科学研究所领导，并迁至北京西路1320号，后又从北京西路迁至靖江路，虹桥路为中试工场。1959年迁至汾阳路138号。

     1960年香料研究室划归轻工业部上海食品科学研究设计院领导。

    1962年9月11日香料研究室单独成立所——轻工业部香料工业科学研究所，由轻工业部和上海市科委双重领导。

    1965年改名为第一轻工业部香料工业科学研究所。

    1969年10月6日“文革”期间，下放上海市，改名为上海日用化学工业研究所（业务方向也改为香料香精、表面活性剂和感光材料研究），由日化公司革委会领导。

     1978年11月改名为上海香料工业科学研究所，收归为直属上海市轻工业局领导。

    1979年4月研究所又恢复原名为轻工业部香料工业科学研究所，由轻工业部领导，隶属轻工业部科学研究院。专门从事香料香精研究。

    1979一1994年在龙吴路137号建立中试和生产基地。

    1994年12月从汾阳路迁往龙吴路137号。

     1995年2月因轻工业部改为中国轻工总会，所名改为中国轻工总会香料研究所。

    1997年在市郊奉城收购占地10亩的化工厂，改造为香料所第二中试和生产基地。

    1999年7月1日香料所由事业单位转制为科技性企业，同年10月更名为上海香料研究所，由原隶属于国家轻工业局划归上海轻工控股（集团）公司。

    2000年11月香料所划归上海家化（集团）有限公司领导。

    2006年3月家化集团将香料所资产整体转让给上海应用技术学院，成为由上海应用技术学院领导的具有独立法人资格的科技型企业。